《里斯本街景》A3101000007 · 2015年9月28日摄于葡萄牙里斯本

公元1580至1640年被称为葡萄牙的「哈布斯堡王朝」时期。

葡萄牙国王塞巴斯蒂安一世绝嗣，恩里克一世继位。西班牙国王腓力二世以塞巴斯蒂安一世舅舅的名义打败了恩里克一世，夺得葡萄牙王位，葡萄牙开始为西班牙哈布斯堡王朝所支配。这个强大的殖民帝国由此从中兴开始走向末路。

1625年，葡萄牙舰队占领了由荷兰人控制的萨尔瓦多城市。但好景不常，1627年，卡斯蒂里亚发生经济崩溃后，荷兰人乘机组织海军破坏了西班牙的海上贸易。自此，英荷两国开始频繁攻击葡萄牙海岸线，由此引发了「西荷战争」。

1638年至1640年间，荷兰逐渐控制了巴西东北部的地区，并以累西腓为首府。尽管数年后葡萄牙在一场战争中打败荷兰，重新夺回了巴西，但荷兰却相继夺得斯里兰卡、好望角和东印度群岛一带的土地，并且垄断了与日本长崎市的全部贸易。自此，葡萄牙在远东的势力仅澳门和东帝汶两地硕果仅存。

公元1661年，葡萄牙慷慨地将孟买和丹吉尔两地送给英国作为两国联姻的嫁妆，但在其他的一百年间，英国不但在印度站稳了脚跟，而且还趁莫卧儿帝国的崩溃逐步控制了几乎整个印度及其贸易，只给葡萄牙留下果阿等地。

1755年，里斯本发生大地震，这对葡萄牙是一次致命的打击。这个曾经不可一世的殖民帝国从此辉煌不再，先前不以为然的巴西这时却成为葡萄牙殖民地的中心，并开始涉足黑人奴隶贸易。

1808年，法国的拿破仑以葡萄牙暗中援助英国为由开始进攻葡萄牙。当时的葡萄牙摄政王若奥亲王为免受波及，把王室迁往了巴西。1812年，若奥六世离开巴西回国时将自己的儿子佩德罗作留了下来作为巴西摄政王。令若奥六世始料未及的是，佩德罗竟趁此机会宣告巴西独立，并于1822年将自己加冕为巴西帝国皇帝。

公元1822年至第二次世界大战结束的1945年，葡萄牙几乎已经失去了其在南美和亚洲的全部领土，只得将目光转向非洲，控制了佛得角、圣多美普林西比、几内亚比绍、安哥拉和莫桑比克等地，企图以此阻止江河日下的颓势，并稍稍挽回一点面子。

1578年6月，葡萄牙国王塞巴斯蒂昂以讨伐异教徒为名，率2.5万雇佣军在丹吉尔登陆，开始了对摩洛哥的战争，摩洛哥被废国王穆泰瓦基勒率部投降，但摩洛哥国王阿卜德 · 马立克率步、骑兵共5万人迎战。8月4日，葡萄牙军在马哈赞河畔的凯比尔堡附近发起进攻，揭开了马哈赞河会战的序幕。由于此役有葡萄牙国王塞巴斯蒂安、摩洛哥废王穆泰瓦基勒和摩洛哥国王马利克三位国王参战，历史上称为「三王之役」。这场战争以葡萄牙人的惨败而告终。

1580年，西班牙兼并葡萄牙。尽管葡萄牙人于1640年再次摆脱了西班牙的统治，但首都里斯本却发生了一场史无前例的大地震，整座城市毁于一旦，所幸的是，王室成员因在热罗尼姆斯大教堂做弥撒而幸免于难。但在接下来的几个世纪中，由于葡萄牙国力逐渐衰弱，其海外殖民纷纷宣告独立，尤其是在第二次世界大战后，尽管葡萄牙拒绝效仿其他殖民主义国家纷纷放弃殖民地，仍然企图维持其殖民帝国的地位和身份，但这一局面并没有能够维持多久。1974年，葡萄牙国内发生军事政变，也就是「康乃馨革命」，这让当时极右的葡萄牙政府在压力面前不得不放弃绝大部分的海外殖民地。

葡萄牙最后的海外殖民地是中国的澳门。随着1999年12月20日中国政府恢复对澳门行使主权，葡萄牙这个称霸世界500年之久的殖民帝国寿终正寝。